1 umu試驗(yàn)簡(jiǎn)介
umu試驗(yàn),又稱SOS/umu試驗(yàn),是1985年由Oda等根據(jù)損傷時(shí)誘導(dǎo)SOS反應(yīng)而表達(dá)umuC基因這一基本原理建立并發(fā)展起來(lái)的檢測(cè)環(huán)境誘變質(zhì)的短期篩選試驗(yàn) 。
1.1 umu定義
umu是UV mutable的縮寫(xiě)形式, 原始含義是經(jīng)紫外線照射引起的突變。umu基因來(lái)源于大腸桿菌, 主要的2種存在形式是umuC和umuD,均屬于DNA聚合酶V。umuC基因的大小為45KDa,其跨越無(wú)堿基位點(diǎn)的合成能力比聚合酶III高100~150倍;umuD基因的大小為15KDa,它能促進(jìn)DNA 損傷的修復(fù)。
umuC和umuD是SOS調(diào)節(jié)子的重要成員, 誘導(dǎo)后才能表達(dá)RecA。憑借它的蛋白酶活性, 把umuD在CYS24和GLY25之間切開(kāi), 得到12KDa的umuD′才是活性形式,umuD在CYS24和GLY25之間切開(kāi), 得到12KDa的umuD′才是活性形式,umuD 非但無(wú)益, 反而有損SOS誘導(dǎo), 在SOS誘變中起作用的是umuD′2C 三元化合物。
1.2 SOS反應(yīng)
菌體的DNA受放射線或致突變物質(zhì)作用受到損傷后合成停止, 受損DNA誘導(dǎo)產(chǎn)生一系列物質(zhì), 同時(shí)啟動(dòng)DNA 修復(fù)所需的酶提高其活力, 使受損的DNA修復(fù), 重新恢復(fù)細(xì)胞分裂, 這一過(guò)程稱為SOS反應(yīng)。此時(shí), 細(xì)胞表現(xiàn)為 DNA 修復(fù)功能增強(qiáng), 細(xì)胞生長(zhǎng)正常, 但分裂受抑制, 基因突變?cè)黾? 呼吸受阻等。細(xì)胞受理化因素?fù)p傷產(chǎn)生的寡核苷酸、單鏈或缺口雙鏈 DNA 等成為誘導(dǎo)信號(hào), 使無(wú)活性的RecA蛋白被激活 , 激活的RecA蛋白可與單鏈DNA(ssDNA)結(jié)合形成 RecA/SDNA 核蛋白體, 后者介導(dǎo) LexA裂解, LexA蛋白水平下降可誘導(dǎo) SOS調(diào)節(jié)子大量轉(zhuǎn)錄 LexA 基因, 同時(shí)也激活原被LexA蛋白阻止的SOS相關(guān)基因 umuC和umuD基因。
圖1 SOS的調(diào)節(jié)原理
圖片來(lái)源:鄭松濤的碩士畢業(yè)論文《土壤樣品毒性評(píng)價(jià)研究一樣品前處理及毒性測(cè)試》
1.3 umu試驗(yàn)
SOS/umu試驗(yàn),即經(jīng)典的umu試驗(yàn),是基于DNA損傷物誘導(dǎo)SOS反應(yīng)而表達(dá)umuC基因的能力, 在鼠傷寒沙門菌(Salmonella. Typhimurium TA1535)中導(dǎo)入攜帶umuC′LacZ嵌合體的質(zhì)粒 Psk1002,該質(zhì)粒攜帶umu操縱子,umuD基因和umuC′LacZ融合基因的啟動(dòng)子及四環(huán)素和氯霉素耐藥基因,允許通過(guò)藥物選擇轉(zhuǎn)化株,新構(gòu)建的細(xì)菌為Styphimurium TA1535/Psk1002。當(dāng)細(xì)菌受到誘變物作用引起SOS反應(yīng)時(shí), 激活umuC′LacZ融合基因, 表達(dá)出有β半乳糖苷酶活性的融合蛋白。根據(jù)此酶分解鄰硝基苯 β-D-半乳糖苷(ONPG)的產(chǎn)物顏色深淺,通過(guò)定量檢測(cè)被誘導(dǎo)酶的數(shù)量,判斷 DNA 是否受損傷及受損傷的程度。
圖2 umu試驗(yàn)原理
圖片來(lái)源:鄭松濤的碩士畢業(yè)論文《土壤樣品毒性評(píng)價(jià)研究一樣品前處理及毒性測(cè)試》
2 umu試驗(yàn)在遺傳毒性研究中的應(yīng)用
目前認(rèn)為,人類90%以上的腫瘤與環(huán)境有關(guān),近年來(lái)環(huán)境污染雖有所控制但其殘留的影響仍不容忽視,適當(dāng)?shù)谋O(jiān)測(cè)系統(tǒng)對(duì)評(píng)估環(huán)境危害非常必要。由于umu基因與DNA損傷密切相關(guān),SOS/umu試驗(yàn)?zāi)芨鼫?zhǔn)確地反映潛在致突變物質(zhì)的遺傳毒性,且因其與Ames 試驗(yàn)的測(cè)試結(jié)果有較好的一致性,具有單一菌種、試驗(yàn)周期短、能夠定量比較、對(duì)實(shí)驗(yàn)環(huán)境要求不嚴(yán)格等優(yōu)點(diǎn),已越來(lái)越受到各個(gè)領(lǐng)域研究的青睞,現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于水、土、空氣樣本的遺傳毒性監(jiān)測(cè)與質(zhì)量的評(píng)估。
20世紀(jì)末,日本將SOS/umu試驗(yàn)作為供水和廢水檢測(cè)的推薦方法;德國(guó)標(biāo)準(zhǔn)化組織發(fā)布DIN 38415標(biāo)準(zhǔn),規(guī)定用SOS/umu試驗(yàn)測(cè)定水的遺傳毒性;國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)化組織2000 年發(fā)布標(biāo)準(zhǔn)ISO13829:2000(E),制定了SOS/umu試驗(yàn)用于水和廢水遺傳毒性的方法標(biāo)準(zhǔn);此外,馬來(lái)西亞在2008年頒布標(biāo)準(zhǔn)MS ISO 13829:2008,將SOS/umu 試驗(yàn)作為標(biāo)準(zhǔn)方法用于廢水的遺傳毒性測(cè)試。土壤是一個(gè)多環(huán)芳烴(PAHs)庫(kù), 日本的 Yoshimitsu Oda 等人用高處理量的umu微平板實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)對(duì)含硝基的多環(huán)芳烴進(jìn)行了研究, 結(jié)果表明umu-微平板實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)是一種快速檢測(cè)微量樣品的有效方法。我國(guó)張徐軍等用SOS/umu實(shí)驗(yàn)檢測(cè)了車站空氣中污染顆粒物中的致癌物質(zhì)的遺傳毒性, 結(jié)果表明未加入S9活化系統(tǒng)時(shí)發(fā)現(xiàn)有遺傳毒性, 并且遺傳毒性有明顯的劑量-反應(yīng)關(guān)系, 但在加入S9活化系統(tǒng)后未發(fā)現(xiàn)遺傳毒性。日本的 Yoshimitsu Oda等人用高處理量的 umu-微平板實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)測(cè)定空氣中傳播的顆粒物的致突變性, 發(fā)現(xiàn)在S9活化系統(tǒng)下, 用含氧-乙酰轉(zhuǎn)移酶( O-AT ) 和硝基還原酶( NR) 的typhimurium NM3009檢測(cè)效果很好。
3 IPHASE umu遺傳毒性檢測(cè)試劑盒
IPHASE基于遺傳毒性檢測(cè)需求,已Styphimurium TA1535/Psk1002為測(cè)試菌株,以96孔板為載體,以4-NQO作為umu試驗(yàn)中樣品遺傳毒性測(cè)定時(shí)的陽(yáng)性對(duì)照,由β-半乳糖苷酶誘導(dǎo)活性值得出的4-NQO活性曲線則作為umu試驗(yàn)菌株活性的判斷依據(jù),借助酶標(biāo)儀的檢測(cè)系統(tǒng),開(kāi)發(fā)出了umu遺傳毒性檢測(cè)試劑盒,助力于遺傳毒性研究。
• 準(zhǔn)確性 與Ames試驗(yàn)的測(cè)試結(jié)果有較好的一致性
• 高通量 可同時(shí)進(jìn)行多個(gè)樣品的遺傳毒性檢測(cè)
• 高效性 試驗(yàn)周期短,試驗(yàn)當(dāng)天即可完成樣品的遺傳毒性的檢測(cè)
• 低要求 對(duì)試驗(yàn)環(huán)境的要求較低,無(wú)需嚴(yán)格的無(wú)菌環(huán)境
圖3 umu試驗(yàn)結(jié)果模式圖
4 相關(guān)產(chǎn)品
IPHASE/匯智和源憑借多年的研發(fā)經(jīng)驗(yàn),推出了多領(lǐng)域、多種類的科研試劑,為藥物早期研發(fā)提供篩選工具,為生命科學(xué)領(lǐng)域的探索提供新材料、新方法和新手段,為遺傳毒性研究提供便捷產(chǎn)品。此外,IPHASE/匯智和源可提供特殊產(chǎn)品的定制服務(wù),望廣大科研工作者咨詢。
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